职称：副研究员（校聘）/硕士生导师

学历：博士研究生

电子邮件：hongxk@fzu.edu.cn

研究方向：生物信息学、深度学习、人工智能

研究生招生专业：生物工程（学硕）、生物技术与工程（专硕）

教育工作经历：

2023年8月-至今：福州大学 | 生物科学与工程学院

2018年9月-2023年6月：上海交通大学 | 系统生物医学研究院 | 生物学 | 博士

2015年8月-2018年6月：中山大学 | 生命科学学院 | 动物学 | 硕士

2011年9月-2015年6月：福州大学 | 生物科学与工程学院 | 生物工程 | 本科

上海交通大学，生命科学技术学院，访问学者

教学简介：

无

科研简介：

主要研究领域为蛋白质翻译后修饰的系统生物学研究，包括：

1. 蛋白质翻译后修饰数据库。

收集和整理蛋白质翻译后修饰的实验数据，提供系统化的信息平台，支持研究者查询和分析修饰位点、类型及其功能关联。

2. 蛋白质翻译后修饰调控蛋白功能的计算解析。

利用计算方法和数学建模，分析修饰如何调控蛋白质的活性、稳定性、相互作用和信号传导，从系统层面揭示修饰的生物学功能。

3. 蛋白质翻译后修饰的人工智能预测方法。

通过机器学习和深度学习等AI技术，预测未知的修饰位点、修饰类型及其功能效应，为修饰研究提供高效的工具和新的研究方向。

目前已在Advanced Science（IF=14.1）、Chemical Engineering Journal （IF=13.2）、Green Chemistry（IF=9.2）和International Journal of Biological Macromolecules（IF=8.5）等国际知名期刊发表SCI论文23篇（中科院1区10篇，中科院2区8篇）；授权2项发明专利和5项计算机软件著作权。

科研项目：

福建省人社厅高层次人才和青年优秀人才培养资助项目

福州大学新进教师科研启动基金

福州大学贵重仪器设备开放测试基金

社会兼职：

厦门市科技专家库专家

福州海关特殊物品风险评估专家

Briefings in Bioinformatics期刊评审专家

代表性论文：

1. Hong X, Lv J, Li Z, Zhu J, Li J, Rahman MU, Wei T, Mu J, Chen HF*. Deep learning model of post-translational modification regulating liquid-liquid phase separation. Communications Chemistry, 2025, 8:393.

2. Xu X#, Hong X#, Zeng W, Yan R, Li F, Meng C, Shi X*, Luo J*, Wang G*. Stereoselective synthesis of (S)-3-Hydroxy-3-phenylpropionate with a novel carbonyl reductase identified from a soda lake metagenome. International Journal of Biological Macromolecules, 2025, 335:149193.

3. Hong X, Li N, Lv J, Zhang Y, Li J*, Zhang J*, Chen HF*. PTMint database of experimentally verified PTM regulation on protein-protein interaction. Bioinformatics, 2023, 39:btac823

4. Hong X, Song K, Rahman MU, Wei T, Zhang Y, Da LT*, Chen HF*. Phosphorylation Regulation Mechanism of β2 Integrin for the Binding of Filamin Revealed by Markov State Model. Journal of Chemical Information and Modeling, 2023, 63:605-618

5. Hong X, Lv J, Li Z, Xiong Y, Zhang J*, Chen HF*. Sequence-based machine learning method for predicting the effects of phosphorylation on protein-protein interactions. International Journal of Biological Macromolecules, 2023, 243:125233

软件著作权：

1. 翻译后修饰调控蛋白互作的数据查询系统【简称：PTMint】

2. 磷酸化修饰调控蛋白互作的人工智能预测系统【简称：PhosPPI】

3. 翻译后修饰调控相分离的数据查询系统【简称：PTMPhaSe】

4. 磷酸化修饰调控相分离的深度学习预测系统【简称：PhosLLPS】

5. 变构蛋白构象的增强采样系统【简称：IDPFold】

获奖情况：

1. 上海交通大学优秀毕业生

2. 硕士研究生国家奖学金

3. 福州大学本科生优秀毕业设计（论文）