教育工作经历：

2024年9月-至今：福州大学，计算机与大数据学院，硕士生导师

2023年7月-至今：福州大学，生物科学与工程学院，硕士生导师

2018年9月-2023年7月：厦门大学，物理科学与技术学院，博士

2015年7月-2018年9月：辽宁大学，生命科学院，硕士

2011年7月-2015年9月：辽宁大学，生命科学院，本科

本科生课程：《生物信息学》

研究生课程：《生物信息学》、《医学大数据与人工智能》、《人工智能辅助药物设计》、《基因组学》

科研简介：

主要从事人工智能与生物医学大数据交叉领域研究，聚焦人工智能驱动的生命健康数据智能建模、知识发现与辅助决策。研究方向涵盖大语言模型（Large Language Models, LLMs）在生物医药场景中的应用、单细胞多模态组学数据智能整合、深度神经网络架构设计、生命动力学系统建模以及复杂系统理论等。围绕高维、异质、稀疏和多模态生命健康数据的分析难题，发展了多种面向生物医学数据挖掘的AI方法与计算框架，推动人工智能在细胞状态识别、细胞异质性解析、发育潜能推断、感染状态判别和药物安全预警等任务中的应用。

近年来，围绕“AI for Biomedicine”和“AI for Science”研究范式，重点开展了人工智能算法与生物医学问题的深度融合研究：一方面，面向单细胞组学数据，构建基于深度学习、表征学习和多模态信息融合的智能分析模型，用于揭示细胞群体结构、调控特征和发育动态规律；另一方面，面向医学知识推理与药物安全场景，探索大语言模型的知识增强、上下文推理与可靠性评估方法，提升人工智能模型在复杂生物医学任务中的可解释性、鲁棒性和可信度。相关研究在单细胞智能分析、医学人工智能、生物医学大数据挖掘和智能药物安全预警等方向形成了较为系统的研究积累与代表性成果。

主持科研项目：

[1]福建省自然科学基金创青项目

[2]福州大学开放测试基金

[3]福州大学科研启动基金

代表性论文：

1. Hu H, Wang L, Chen LQ, Lin H, Huang LT, Wang ZW, Hou XM. Benchmarking Large Language Models for Drug Combination Alerts: Achieving Expert-Level Reliability via Knowledge Grounding and Contextual Reasoning. J Med Chem. 2026 Feb 12;69(3):3477-3489. （医学1区top，IF=7.2，封面论文）

2. Lin H, Hu H, Feng Z, Xu F, Lyu J, Li X, Liu L, Yang G, Shuai J. SCTC: inference of developmental potential from single-cell transcriptional complexity. Nucleic Acids Res. 2024 Jun 24;52(11):6114-6128. （医学1区，IF=13.1）

3. Xu F, Hu H, Lin H, Lu J, Cheng F, Zhang J, Li X, Shuai J. scGIR: deciphering cellular heterogeneity via gene ranking in single-cell weighted gene correlation networks. Brief Bioinform. 2024 Jan 22;25(2):bbae091. （数学与计算生物学1区，IF=8.7）

4. Meng R, Yin S, Sun J, Hu H*, Zhao Q*. scAAGA: Single cell data analysis framework using asymmetric autoencoder with gene attention. Comput Biol Med. 2023 Oct;165:107414.（数学与计算生物学1区，IF=6.698，通讯作者）

5. Hu H, Feng Z, Lin H, et al., Identifying SARS-CoV-2 infected cells with scVDN, Front. Microbiol., 2023 Jul 10;14:1236653.（生物学2区top，IF=6.064）

6. Hu H, Feng Z, Lin H, et al., Gene function and cell surface protein association analysis based on single-cell multiomics data, Comput. Biol. Med., 2023 Mar 1（数学与计算生物学1区，IF=6.698，高被引论文）

7. Hu H, Feng Z, Lin H, et al., Modeling and analyzing single-cell multimodal data with deep parametric inference, Brief Bioinform., 2023 Jan 19;24(1):bbad005.（数学与计算生物学1区，IF=13.994，高被引论文）

8. Hu H, Liu R, Zhao C, et al., CITEMOXMBD: A flexible single-cell multimodal omics analysis framework to reveal the heterogeneity of immune cells, RNA Biol, 2022 Jan;19(1):290-304.（生物学3区，IF=4.766）

9. Liu R, Hu H, McNeil M, et al., Dormant Nfatc1 reporter-marked basal stem/progenitor cells contribute to mammary lobuloalveoli formation, iScience, 2022 Feb 26;25(3):103982. （综合性期刊2区，IF=6.107）

10. Hu H, Zhang L, Ai H, et al., HLPI-Ensemble: Prediction of human lncRNA-protein interactions based on ensemble strategy, RNA Biol., 2018;15(6):797-806.（生物学3区，IF=4.766）

授权专利情况：

[1]《一种处理单细胞多模态组学数据的深度学习方法及系统》（已授权）

[2]《单细胞转录组数据伪时间轨迹的分析方法及计算机系统》（已授权）